Dès 1990, sous la pression de l’Uruguay Round, la politique agricole suisse amorce un changement de direction. Petit à petit, la politique des prix est remplacée par des paiements directs, non liés à la production. Dès cet instant, l’agriculteur s’est vu confier le rôle de protecteur de l’environnement, via un contrat social avec la collectivité. Quatorze ans après l’entrée en vigueur de cette nouvelle politique, le bilan est très mitigé. L’environnement subit des atteintes irréversibles, les inégalités de traitement entre les agriculteurs sont manifestes, le contrôle de prestations écologiques est réalisé par les agriculteurs eux-mêmes. Les agriculteurs du canton du Jura, par leurs très grandes surfaces agricoles utiles, perçoivent quelques 80'000'000.- de francs de paiements directs par année (environ 1100 exploitations).